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生物 x 資訊 x 創業日常

NGS QIIME2 : 尋找生物標記(Biomarker) LEfSe + dokdo 套件 (中-實作) -23

透過 dokdo 製作 LEfSe 輸入資料 在已經裝好 dokdo 的 QIIME2 環境下輸入,不需要跑很 […]

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NGS QIIME2 : 尋找生物標記(Biomarker) LEfSe + dokdo 套件 (上-原理與安裝) -22

尋找各組別的 Biomarker 菌種 為方便後續講解我們做個小約定,不同階層的分類名稱之為分類單元,例如菌物 […]

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NGS 定序分析報錯 : 那些分析時遇到的蟲子們 -21

沒有寫過程式就不會遇到 BUG 本篇介紹執行定序分析常見的報錯情境,而報錯的方式千百種,查詢解決方法就一種: […]

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統整 NGS 次世代定序 16S rRNA 生資分析學習地圖

次世代定序 16S rRNA 生物資訊分析教學地圖 在本篇文章整理 20 篇以次世代定序 (NGS) 16S […]

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NGS QIIME2 : 分析與繪製微生物基因功能預測 PICRUSt2 + STAMP (下) -20

分析學術定序報告請至本頁中 →STAMP 圖形化介面視覺化軟體 章節開始閱讀。 預測酵素及代謝途徑豐富度 PI […]

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NGS QIIME2 : 分析與繪製微生物基因功能預測 PICRUSt2 + STAMP (上) -19

微生物在群體中扮演什麼角色-PICRUSt2 功能預測 經歷了品質管制、物種分配、多樣性分析,多半只聞菌名,不 […]

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